Введение. В условиях перехода к экспортно ориентированной экономике инновационное развития аграрного сектора является безальтернативным инструментом обеспечения национальной безопасности государства. Теоретический анализ. В статье рассматриваются теоретические и методические аспекты формирования региональных инновационных агросистем в контексте концепции национальной инновационной системы.